Leta i den här bloggen

torsdag 6 juli 2017

Etikkahaposta glysiiniksi ( alfa-aminoetikkahapoksi)

Alfa- AMINOHAPPORAKENTEESTA

Kaksi hiiliatomia C2 on  etikkahapossa acetic acid ( C2:0) 

Glysiinissä on sen lisäksi yksi aminoryhmkä -NH2

Keho rakentaa hiiliketjuista karboksyylihapoista ( C.- päädyssä on COOH-ryhmä, karboksyyliryhmä) 
pienistä orgaanisista hapoista ja pitemmistä, jo  rasvahapoiksi sanotuista karboksyylihaposita,  käsin aminohappoja.
Etikkahappo on C-COOH kahden hiilen happo.
 Hiileen mahtuu neljä sidosta, joten  tässä yllä  en laittanut  näkyviin protoneja, vetyjä 
Tässä laitan vedyt näkyviin:  CH3-C(O)OH .

COOH ryhmän vieressä oleva ensimmäin hiili on alfahiili.
Alfa-hiileen tulee transaminaatiolla aminoryhmä -NH2) . Entsyymit ovat sitä transaminaatiota varten. 

Jos ETIKKAHAPPO eli asetaatti (Acetic Acid), saa alfa-hiileen aminoryhmän, siitä tulee
alfa-amino-etikkahappo. Tämä on saanut nimen GLYSIINI (Glycine).

Glysiini on proteogeeninen aminohappo. Se menee kasvi ja eläinkunnassa proteiinien tekemiseen. Esim soijan nimenä on Glycine Max. 

Ihmisessä glysiiniä on kollageenissa joka kolmas aminohappo.
 
C on hiiliatomi Carbonum), kolatom
H on vetyatomi (Hydrogenum) , väteatom
O on happiatomi (Oxygenum) , syreatom
N on typpiatomi (Nitrogenum) , kväveatom

Glysiini on pienin alfa-aminohappo. 
 
Sen lyhennys on Gly, tai proteiinin rakenteen peptidijärjestyksissä G.

Jos tutkitaan esim kollageeni1 proteiinista kaikki aminohappotyypit ja katsotaan kuinka paljon niistä on glysiinejä, glysiinin osuudeksi tulee miltei kolmasosa.

Sen takia geneettinen järjestelmä, joka liittää glysiiniä aminohappoketjuun, on tärkeä ihmisen normaalin fyysisen rakenteen koostamisessa. (GARS , sen entsyymin geeni, joka suorittaa  tällaista)

Sen lisäksi jokaisen eri proteiinin DNA koodit ovat olennaiset  ( jokaiselle uudelle yksilölle individuellisti annettu, uudisluotu toteutumismahdollisuus, se malli ja järjestys, jolla kehokoneisto koostaa peptidit) 

Eri proteiinien koodeissa, geenissä, voi jo olla jokin muuntuma, jolloin tarvittavan proteiinin ”optimaalinen” tuotanto voi olla haittaantunutta, vaikka normaalisti valmistuneen glysiinin oma liittäminen tRNA-syntetaasilla (GARS) peptidiin olisikin moitteeton. 

Opetimaalisella on maailamssa suuret raja-arvot ottaen huomioon että vaikka eletään maapallolla avaruus ympärillä, elinkykyistä kansaa on miljardittain, joten varsinaisesti nämä proteiinijärjestelmät ovat hyvin konservoituja ja jos ne eivät toimisi, hedelmöittyminenkin jo olisi heikkoa ja  alkiot eivät edes kehittyisi sikiöasteelle tai syntyisi ilmasto-olosuhteisiin,  poistuminen  emokehosta jo olisi liika stressi, ylivoimaista aikka koko  lääketieteen tekniikka olisi apuna.

 Mitä sitten jää pohdittavaksi se on hienosäätöä tällä alalla. Jokainen uusi yksilö on uusi kombinaatio elinkykyisistä elinmahdollisuuksista ja sen takia voidaan sanoa, että pojasta polvi paranee ja se ehkä on takana maailman väkiluvun kasvussa. Toivottavasti nuori väki ymmärtää, että kannataa hankkia jlkeläiset   nuorina aikuisina.  Luoja kyllä luo niitä kombinaatioita ja  parempia elinmahdollisuuksia on luvassa loogisesti ajatellen.

Muistiin 6.7. 2017

Aminohappojen tRNA-ligaasigeenejä lisää


Name/Gene IDDescriptionLocationAliasesMIM
ID: 8923217
tRNA [Homo sapiens ssp. Denisova (Denisova hominin)]Chromosome MT, NC_013993.1 (5583..5651, complement)

ID: 6775093
tRNA [Homo sapiens neanderthalensis (Neandertal)]Chromosome MT, NC_011137.1 (5582..5650, complement)

ID: 4553
mitochondrially encoded tRNA alanine [Homo sapiens (human)]Chromosome MT, NC_012920.1 (5587..5655, complement)MTTA, TRNA
ID: 9255
aminoacyl tRNA synthetase complex-interacting multifunctional protein 1 [Homo sapiens (human)]Chromosome 4, NC_000004.12 (106315610..106349225)EMAP2, EMAPII, HLD3, SCYE1, p43603605
ID: 3735
lysyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 16, NC_000016.10 (75627724..75647687, complement)CMTRIB, DFNB891, KARS2, KRS, KARS601421
ID: 8565
tyrosyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 1, NC_000001.11 (32775239..32818032, complement)CMTDIC, TYRRS, YRS, YTS603623
ID: 2058
glutamyl-prolyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 1, NC_000001.11 (219968600..220046658, complement)EARS, GLUPRORS, PARS, PIG32, QARS, QPRS138295
ID: 16
alanyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 16, NC_000016.10 (70252295..70289550, complement)CMT2N, EIEE29601065
ID: 51520
leucyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 5, NC_000005.10 (146113026..146182787, complement)HSPC192, ILFS11, LEURS, LEUS, LFIS, LRS, PIG44, RNTLS, hr025Cl, LARS151350
ID: 7453
tryptophanyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 14, NC_000014.9 (100333788..100376343, complement)GAMMA-2, IFI53, IFP53191050
ID: 54901
CDK5 regulatory subunit associated protein 1-like 1 [Homo sapiens (human)]Chromosome 6, NC_000006.12 (20534457..21232404)
611259
ID: 55157
aspartyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial [Homo sapiens (human)]Chromosome 1, NC_000001.11 (173824645..173858544)ASPRS, LBSL, MT-ASPRS610956
ID: 5917
arginyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 5, NC_000005.10 (168486458..168519306)ArgRS, DALRD1, HLD9107820
ID: 2617
glycyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 7, NC_000007.14 (30594565..30634033)CMT2D, DSMAV, GlyRS, HMN5, SMAD1600287
ID: 60528
elaC ribonuclease Z 2 [Homo sapiens (human)]Chromosome 17, NC_000017.11 (12991612..13018064, complement)COXPD17, ELC2, HPC2605367
ID: 4141
methionyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 12, NC_000012.12 (57487953..57516655)CMT2U, ILFS2, ILLD, METRS, MRS, MTRNS, SPG70156560
ID: 51095
tRNA nucleotidyl transferase, CCA-adding, 1 [Homo sapiens (human)]Chromosome 3, NC_000003.12 (3126916..3152503)CCA1, CGI-47, MtCCA, SIFD612907
ID: 23395
leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial [Homo sapiens (human)]Chromosome 3, NC_000003.12 (45388561..45548842)LEURS, PRLTS4604544
ID: 6301
seryl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 1, NC_000001.11 (109213893..109238182)SERRS, SERS607529
ID: 3035
histidyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 5, NC_000005.10 (140673904..140691727, complement)HRS, USH3B142810

ARS geenejä

Name/Gene IDDescriptionLocationAliasesMIM
ID: 9255
aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 [Homo sapiens (human)]Chromosome 4, NC_000004.12 (106315610..106349225)EMAP2, EMAPII, HLD3, SCYE1, p43603605
ID: 7965
aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2 [Homo sapiens (human)]Chromosome 7, NC_000007.14 (6009241..6023834)JTV-1, JTV1, P38600859
ID: 2058
glutamyl-prolyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 1, NC_000001.11 (219968600..220046658, complement)EARS, GLUPRORS, PARS, PIG32, QARS, QPRS138295
ID: 9521
eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon 1 [Homo sapiens (human)]Chromosome 6, NC_000006.12 (8073360..8102595, complement)AIMP3, P18609206
ID: 1191
clusterin [Homo sapiens (human)]Chromosome 8, NC_000008.11 (27596917..27616717, complement)AAG4, APO-J, APOJ, CLI1, CLU2, KUB1, NA1/NA2, SGP-2, SGP2, SP-40, TRPM-2, TRPM2, CLU185430
ID: 170547
aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 pseudogene 1 [Homo sapiens (human)]Chromosome 20, NC_000020.11 (14127331..14128413)SCYE1P, bA400P21.1
ID: 100873064
aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1 pseudogene 2 [Homo sapiens (human)]Chromosome 1, NC_000001.11 (172885947..172886258, complement)

ID: 3735
lysyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 16, NC_000016.10 (75627724..75647687, complement)CMTRIB, DFNB891, KARS2, KRS, KARS601421
ID: 4141
methionyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 12, NC_000012.12 (57487953..57516655)CMT2U, ILFS2, ILLD, METRS, MRS, MTRNS, SPG70156560
ID: 8565
tyrosyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 1, NC_000001.11 (32775237..32818032, complement)CMTDIC, TYRRS, YRS, YTS603623
ID: 5859
glutaminyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 3, NC_000003.12 (49095932..49105129, complement)GLNRS, MSCCA, PRO2195603727
ID: 5917
arginyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 5, NC_000005.10 (168486458..168519306)ArgRS, DALRD1, HLD9107820
ID: 51520
leucyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 5, NC_000005.10 (146113026..146182787, complement)HSPC192, ILFS11, LEURS, LEUS, LFIS, LRS, PIG44, RNTLS, hr025Cl, LARS151350
ID: 3376
isoleucyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 9, NC_000009.12 (92210207..92293756, complement)GRIDHH1, ILERS, ILRS, IRS, PRO0785, IARS600709
ID: 6386
syndecan binding protein [Homo sapiens (human)]Chromosome 8, NC_000008.11 (58553169..58582860)MDA-9, MDA9, ST1, SYCL, TACIP18602217
ID: 1615
aspartyl-tRNA synthetase [Homo sapiens (human)]Chromosome 2, NC_000002.12 (135905881..135986046, complement)HBSL, aspRS603084
ID: 8880
far upstream element binding protein 1 [Homo sapiens (human)]Chromosome 1, NC_000001.11 (77944055..77979494, complement)FBP, FUBP, hDH V603444
ID: 3094
histidine triad nucleotide binding protein 1 [Homo sapiens (human)]Chromosome 5, NC_000005.10 (131159283..131165348, complement)HINT, NMAN, PKCI-1, PRKCNH1601314
ID: 23395
leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial [Homo sapiens (human)]Chromosome 3, NC_000003.12 (45388561..45548842)HLASA, LEURS, PRLTS4, mtLeuRS604544
ID: 55157
aspartyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial [Homo sapiens (human)]

onsdag 5 juli 2017

Alfa-keto voihaposta sitruunahapposykliin.( Biotiini, B12 vitamiini)

Treoniinidehydrataasientsyymi tekee treoniinista (T)   alfaketovoihappoa.
Myös cystathionista ja metioniinista (M)  sekä homocysteiinistä tulee alfaketovoihappoa. (alfa-keto butyrate )
Wikipedia esittää hienosti, miten tästä sitten eteenpäin saadaan hiiliketjut talteen  aktiovidun propionihapon  asetuttua mitokondrioon  ja siellä käsiteltäväksi - ensin tämä 3 hiilen aktivoitu rasvahappo pidennetään  biotiinin avulla ja syntynyt metyylimalonihappo (MMA)   "väännetään" ja "oikaistaan" B12- vitamiinin avulla  meripihkahappohahmoon,  jolloin se kelpaa sitruunahapposykliin.
(  siitä kohdasta, missä on meripihkahappo, succinate) .
https://en.wikipedia.org/wiki/Alpha-Ketobutyric_acid 

 Löytyi netistä kuva ( vasemmalla metyylimaloni happo ja oikealla B12 vitamiinin avulla  "oikaistuksi väännetty  meripihkahappo".
 http://www.biotage.com/news/application-suite-for-extraction-of-methylmalonic-acid

"Methylmalonic acid (MMA) in serum is measured to help diagnose a number of disorders, primarily vitamin B12 deficiency. This suite of application notes describe the extraction of MMA from serum using a number of different extraction techniques (solid phase extraction, phospholipid depletion and supported liquid extraction)".
Structures of methylmalonic acid (MMA) and succinic acid (SA).
Structures of methylmalonic acid (MMA) and succinic acid (SA).


Suomalainen Wikipediateksti on ilmestynyt alkuvuodesta 2017.

α-Ketovoihappo eli alfaketovoihappo (C4H6O3) on ketokarboksyylihappoihin kuuluva orgaaninen yhdiste. Yhdistettä esiintyy välituotteena aminohappojen biosynteesi- ja hajotusreaktioissa.
α-Ketovoihappoa muodostuu treoniinista treoniinideaminaasin katalysoimana. Yhdistettä muodostuu myös kysteiinin biosynteesin sivutuotteessa, kun kystationiini hajoaa kysteiiniksi ja α-ketovoihapoksi kystationaasin katalysoimana. Näissä reaktioissa muodostunut α-ketovoihappo voidaan prosessoida edelleen propionyylikoentsyymi-A:ksi α-ketohappodehydrogenaasikompleksin katalysoimana. Eräät eliöt kykenevät syntetisoimaan isoleusiinia α-ketovoihaposta.[2][3][4]
Sotoloni on laktoneihin kuuluva aromiyhdiste, joka antaa ranskalaiselle viinille Vin jaune sen tyypillisen maun. Sotolonia muodostuu viiniin käymisprosessin aikana asetaldehydistä ja α-ketovoihaposta.

ALANIINIA koskevaa. Alaniini- tRNA- syntetaasi AARS

 Alaniinia koskevaa
AARS, Kr. 16q22.1  (sytoplasminen entsyymi )
AARS2, Kr. 6p21.1. ( mitokondriaalinen)
  • AARS alanyl-tRNA synthetase [ Homo sapiens (human) ]

Gene ID: 16, updated on 4-Jun-2017
Official Symbol
AARSprovided by HGNC
Official Full Name
alanyl-tRNA synthetaseprovided by HGNC
Primary source
HGNC:HGNC:20
See related
Ensembl:ENSG00000090861 MIM:601065; Vega:OTTHUMG00000177042
Gene type
protein coding
RefSeq status
REVIEWED
Organism
Homo sapiens
Lineage
Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae; Homo
Also known as
CMT2N; EIEE29
Summary
The human alanyl-tRNA synthetase (AARS) belongs to a family of tRNA synthases, of the class II enzymes. Class II tRNA synthases evolved early in evolution and are highly conserved. This is reflected by the fact that 498 of the 968-residue polypeptide human AARS shares 41% identity witht the E.coli protein. tRNA synthases are the enzymes that interpret the RNA code and attach specific aminoacids to the tRNAs that contain the cognate trinucleotide anticodons. They consist of a catalytic domain which interacts with the amino acid acceptor-T psi C helix of the tRNA, and a second domain which interacts with the rest of the tRNA structure. [provided by RefSeq, Jul 2008]Related articles in PubMed
  1. A novel AARS mutation in a family with dominant myeloneuropathy. Motley WW, et al. Neurology, 2015 May 19. PMID 25904691, Free PMC Article Mitokondriaali
  2. A recurrent loss-of-function alanyl-tRNA synthetase (AARS) mutation in patients with Charcot-Marie-Tooth disease type 2N (CMT2N). McLaughlin HM, et al. Hum Mutat, 2012 Jan. PMID 22009580, Free PMC Article
See all (38) citations in PubMed
See citations in PubMed for homologs of this gene provided by HomoloGene
 
GeneRIFs: Gene References Into Functions
  1. cytoplasmic Alanyl-tRNA synthetase may have a role in dominant axonal Charcot-Marie-Tooth disease, as shown by its mutation in a major determinant for binding and aminoacylation

AARS2, (mitokondriaalinen entsyymi)

  • AARS2 alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial [ Homo sapiens (human) ]

Gene ID: 57505, updated on 4-Jun-2017
Official Symbol
AARS2provided by HGNC
Official Full Name
alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialprovided by HGNC
Primary source
HGNC:HGNC:21022
See related
Ensembl:ENSG00000124608 MIM:612035; Vega:OTTHUMG00000014766
Gene type
protein coding
RefSeq status
REVIEWED
Organism
Homo sapiens
Lineage
Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae; Homo
Also known as
AARSL; LKENP; COXPD8; MTALARS; MT-ALARS
Summary
The protein encoded by this gene belongs to the class-II aminoacyl-tRNA synthetase family. Aminoacyl-tRNA synthetases play critical roles in mRNA translation by charging tRNAs with their cognate amino acids. The encoded protein is a mitochondrial enzyme that specifically aminoacylates alanyl-tRNA. Mutations in this gene are a cause of combined oxidative phosphorylation deficiency 8. [provided by RefSeq, Dec 2011]
Orthologs
mouse all
Related articles in PubMed
  1. Novel AARS2 gene mutation producing leukodystrophy: a case report. Szpisjak L, et al. J Hum Genet, 2017 Feb. PMID 27734837
  2. Novel (ovario) leukodystrophy related to AARS2 mutations. Dallabona C, et al. Neurology, 2014 Jun 10. PMID 24808023, Free PMC Article
  3. Exome sequencing identifies mitochondrial alanyl-tRNA synthetase mutations in infantile mitochondrial cardiomyopathy. Götz A, et al. Am J Hum Genet, 2011 May 13. PMID 21549344, Free PMC Article
See all (25) citations in PubMed
See citations in PubMed for homologs of this gene provided by HomoloGene
 
GeneRIFs: Gene References Into Functions
  1. Observational study of gene-disease association. (HuGE Navigator)


Muistiin 5.6. 2017

Treoniinia koskevaa. TARS on treonyyli- tRNA- syntetaasin geeni

Muistiin 5.6. 2017

3. Treoniinia koskevaa

TARS Kr. 5p13.8
TARS2 Kr. 1Q21.2 , mitokondriaalinen
Pseudogeeni Kr. 4.
TARSL2 Kr. 15q26.3.


  • TARS threonyl-tRNA synthetase [ Homo sapiens (human) ]

Gene ID: 6897, updated on 4-Jun-2017
Official Symbol
TARSprovided by HGNC
Official Full Name
threonyl-tRNA synthetaseprovided by HGNC
Primary source
HGNC:HGNC:11572
See related
Ensembl:ENSG00000113407 MIM:187790; Vega:OTTHUMG00000090683
Gene type
protein coding
RefSeq status
REVIEWED
Organism
Homo sapiens
Lineage
Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae; Homo
Also known as
ThrRS
Summary
Aminoacyl-tRNA synthetases catalyze the aminoacylation of tRNA by their cognate amino acid. Because of their central role in linking amino acids with nucleotide triplets contained in tRNAs, aminoacyl-tRNA synthetases are thought to be among the first proteins that appeared in evolution. Threonyl-tRNA synthetase belongs to the class-II aminoacyl-tRNA synthetase family [provided by RefSeq, Jul 2008]
Orthologs
mouse all
Related articles in PubMed
  1. Kinetic mechanism of threonyl-tRNA synthetase from human placenta. Pan F, et al. Int J Pept Protein Res, 1982 Aug. PMID 7118437
  2. Purification and subunit structure studies of human placental threonyl-tRNA synthetase. Pan F, et al. Int J Pept Protein Res, 1982 Mar. PMID 7118399
See all (45) citations in PubMed
See citations in PubMed for homologs of this gene provided by HomoloGene
GeneRIFs: Gene References Into Functions
  1. A previously undiscovered function for TARS as an angiogenic, pro-migratory extracellular signaling molecule.


  • TARSL2 threonyl-tRNA synthetase like 2 [ Homo sapiens (human) ]

Gene ID: 123283, updated on 4-Jun-2017
Official Symbol
TARSL2provided by HGNC
Official Full Name
threonyl-tRNA synthetase like 2provided by HGNC
Primary source
HGNC:HGNC:24728
See related
Ensembl:ENSG00000185418 Vega:OTTHUMG00000149869
Gene type
protein coding
RefSeq status
VALIDATED
Organism
Homo sapiens
Lineage
Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae; Homo
Related articles in PubMed
  1. Panorama of ancient metazoan macromolecular complexes. Wan C, et al. Nature, 2015 Sep 17. PMID 26344197, Free PMC Article
  2. A proteome-scale map of the human interactome network. Rolland T, et al. Cell, 2014 Nov 20. PMID 25416956, Free PMC Article
  3. A human interactome in three quantitative dimensions organized by stoichiometries and abundances. Hein MY, et al. Cell, 2015 Oct 22. PMID 26496610
See all (10) citations in PubMed
See citations in PubMed for homologs of this gene provided by HomoloGene
GeneRIFs: Gene References Into Functions
  1. Clinical trial of gene-disease association and gene-environment interaction. (HuGE Navigator)

(TARS2 oletettu mitokondriaalinen)

  • TARS2 threonyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) [ Homo sapiens (human) ]

Gene ID: 80222, updated on 8-Jun-2017
Official Symbol
TARS2provided by HGNC
Official Full Name
threonyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative)provided by HGNC
Primary source
HGNC:HGNC:30740
See related
Ensembl:ENSG00000143374 MIM:612805; Vega:OTTHUMG00000012809
Gene type
protein coding
RefSeq status
REVIEWED
Organism
Homo sapiens
Lineage
Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae; Homo
Also known as
thrRS; TARSL1; COXPD21
Summary
This gene encodes a member of the class-II aminoacyl-tRNA synthetase family. The encoded protein is a mitochondrial aminoacyl-tRNA synthetase. Alternative splicing results in multiple transcript variants. A related pseudogene has been identified on chromosome 4. [provided by RefSeq, Dec 2012]
Orthologs
mouse all
Related articles in PubMed
  1. A functional peptidyl-tRNA hydrolase, ICT1, has been recruited into the human mitochondrial ribosome. Richter R, et al. EMBO J, 2010 Mar 17. PMID 20186120, Free PMC Article
See all (21) citations in PubMed
See citations in PubMed for homologs of this gene provided by HomoloGene
GeneRIFs: Gene References Into Functions
  1. Meta-analysis of gene-disease association. (HuGE Navigator)
Muis 5,7, 2017 tiin entsyymistä, joka etsii ja liittää  treoniinin  sen omalle  tRNA:lle.


Aminohappojen tRNA on tieteen fokuksessa nykyisin

Hum Mol Genet. 2017 Jun 15. doi: 10.1093/hmg/ddx231. [Epub ahead of print] Emerging Mechanisms of Aminoacyl-tRNA Synthetase Mutations in Recessive and Dominant Human Disease. Meyer-Schuman R1, Antonellis A1.

Tiivistelmä, Abstract

Aminohapon tRNA -syntetaasi  (ARS) vastaa siitä, että oikeat  aminohapot  tulevat oikeille  kuljettaja-RNA-molekyyleille. Tämä onkin välttämätön ensimmäinen askel proteiinin transloitumisessa (luennassa DNA- peräisen koodin lähetti RNA:sta  aminohappoketjuiksi).

 Monessa ihmisen perinnöllisessä sairaudessa on havaittu mutaatioita juuri näissä geeneissä, jotka koodaavat ARS- entsyymejä.  Jos  mutaatio on molemmassa ARS-  alleelissa, aiheutuu vaikavia , varhain alkavia resessiivisiä tauteja, jotka koskevat monia kudoksia. Suuressa osassa sellaisia mutaatioita on funktion katoamisvaikutuksia ja proteiinin translaatiovirheitä. Sensijaan ei olla selvillä siitä, miten jokin alatyyppi aiheuttaa kudosspesifisiä fenotyyppejä.

 Mutta päinvastoin on dominanttien ARS- välitteisten tautien suhteen. Ne vikuuttavat erityisesti perifeeristä hermojärjestelmää, tavallisimmin aiheuttavat axonaalistia  perifeeristä neuropatiaa ja ilmenevät  elämän myehemmissä vaiheissa. Nämä neuropatiat linkkiytyvät  viiden ARS- geenin heterogeenisiin   missense- mutaatioihin, mikä osoittaa  tautimekanismiin osaltaan osallistumista. Kuitenkaan ei ole selvää, jos funktion katomekanismi  tai toksinen "gain function" funktion ylipainotus,   on vastaamassa ARS- välitteisestä neuropatiasta  tai jos   molemmat mekanismit operoivat kombinaationa mutaatiospesifiseltä pohjalta.

 Tässä artikkelissa  tehdään katsausta nykyisestä käsityksestä ARS-välitteisistä ressessiivisistä ja dominanteista taudeista. Tutkijat ehdottamat myös  tulevia suuntia ARS-mutaatioitten molekulaarisen mekanismin määrittämiseksi, jotta voidaan  hahmotella terapioita   kyseesä olevalle potilasväestölle.

  • Aminoacyl-tRNA synthetases (ARSs) are responsible for charging amino acids to cognate tRNA molecules, which is the essential first step of protein translation. Interestingly, mutations in genes encoding ARS enzymes have been implicated in a broad spectrum of human inherited diseases. Bi-allelic mutations in ARSs typically cause severe, early-onset, recessive diseases that affect a wide range of tissues. The vast majority of these mutations show loss-of-function effects and impair protein translation. However, it is not clear how a subset cause tissue-specific phenotypes. In contrast, dominant ARS-mediated diseases specifically affect the peripheral nervous system-most commonly causing axonal peripheral neuropathy-and usually manifest later in life. These neuropathies are linked to heterozygosity for missense mutations in five ARS genes, which points to a shared mechanism of disease. However, it is not clear if a loss-of-function mechanism or a toxic gain-of-function mechanism is responsible for ARS-mediated neuropathy, or if a combination of these mechanisms operate on a mutation-specific basis. Here, we review our current understanding of recessive and dominant ARS-mediated disease. We also propose future directions for defining the molecular mechanisms of ARS mutations toward designing therapies for affected patient populations.
  • © The Author 2017. Published by Oxford University Press.