Yleistietoa luomakunnan formiineista. Silmäys mtFH geenien tarkkaan tutkimukseen kasvikunnan puolla.

 Löysin luomakunnan alueelta  fylogeneetistä tietoa etsiessäni formiineista alle liitetyn abstraktin jonka ovat kirjoittaneet  Jiatong Wang et Chnyang Zhao  työssään " Genome wide characterization and analysis pf the FH gene family in Medicago truncatula under abiotic stresses, May 2025.  Alleviivaan kohtia jotka ovat merkityksellisiä mielestäni geenin ominaisuuksista, jos ja kun  geeni  evoluutiossa ilmenee  ihmiskunnassa. 

Suomennosta: Tiivistelmä ja kuvia: 

Abstract and Figures

 Taustaa. FORMIINI-proteiiniperhe omaa tärkeän osansa lineaarin aktiinin kokoontumisessa ja kidemuodostuksessa ; se myös voi edistää aktiinifilamenttien muodostumista Arp2/3-kompleksista riippum,attomalla tavalla. FORMIINI-geeniperhe  on  yksi avainproteiineista säätelemässä sytoskeletonia ja solumorfologian  rakenteita:   tätä pn  kasvikunnan alueella laajalti  selvitetty esimerkiksi Arabidopsis thaliana lajista ja riisistä 

• Background: The formin family proteins play an important role in guiding the assembly and nucleation of linear actin and can promote the formation of actin filaments independently of the Arp2/3 complex. As a key protein that regulates the cytoskeleton and cell morphological structure, the formin gene family has been widely studied in plants such as Arabidopsis thaliana and rice. 

 

Metodeita:  Tässä työssään  tutkijat suorittivat  laajoja analyysejä. He konstruoivat   fylogeenettisen puun , tunnistivat konservoidun motiivin, analysoivat  samaan yhteyteen  kuuluvien geeni-ilmenemien verkoston ja  selvittivät  transkriptomitietoja. He tunnistivat kaiken kaikkiaan 18 MtFH-geeniperheen jäsentä, eikä näiden geenien  sijoittuma kromosomistoon ollut yksioikoinen. 

 

• Methods: In this study, we conducted comprehensive analyses, including phylogenetic tree construction, conserved motif identification, co-expression network analysis, and transcriptome data mining. Results: A total of 18 MtFH gene family members were identified, and the distribution of these genes on chromosomes was not uniform.

 

 Fylogeneettisen puun mukaan  haarautuivat FH-proteiinit neljään  lajiin, joissa oli havaittavissa kaksi  laajahkoa alaryhmää, Kladi 1 ja Kladi2.

  Huomattiin että Medicago truncatula ja soijapapu  omasivat  fylogeneettistä sukulaisuutta. 

 

•  The phylogenetic tree divided the FH proteins of the four species into two major subgroups (Clade I and Clade II).  Notably Medicago truncatula and soybean exhibited closer phylogenetic relationships.

Analysoitaessa cis-aktiiveja elementtejä  selvisi MtFH geenin mahdollinen säätelevä osuus  valovasteessa, hormonivasteessa ja  stressivasteessa. GO-rikastusanalyysissä  tuli osoitettua jälleen FH:n tärkeys reaktioissa, kuten  aktiinin nukleoitumisessa.

 Geeniekspressiota  selvitettäessä  ilmeni, että MtFH geenit  vastasivat  merkitsevästi  kylmän, kuivuuden ja suolan  aiheuttamiin stresseirhin. 

Lisäksi ilmeni joidenkin geeni-ilmenemien kesken  stressin aikaista hetkellistä  komplementaarista  suhdetta.

 Geenien koodaamien proteiinien  interaktioverkostossa oli viitettä  MtFH-proteiinien  ja profiliinin keskinäisestä suhteesta jne. 

 Lisäksi postranslationaaliselta tasolta  oli seulottavissa esiin   22 mikroRNA:ta   mahdollisina MtFH-geenien säätelijöinä.  

 

•  The analysis of cis-acting elements revealed the potential regulatory role of the MtFH gene in light response, hormone response, and stress response. GO enrichment analysis again demonstrated the importance of FH for reactions such as actin nucleation. Expression profiling revealed that MtFH genes displayed significant transcriptional responsiveness to cold, drought, and salt stress conditions. And there was a temporal complementary relationship between the expression of some genes under stress.  The protein interaction network indicated an interaction relationship between MtFH protein and profilin. . In addition, 22 miRNAs were screened as potential regulators of the MtFH gene at the post-transcriptional level.

 Yhteenveto: Yleisesti ottaen tämä tutkimus syventää  MtFH-geenien fysiologisen funktion ymmärtämistä  ja antaa  referenssigeenin maanviljelystuotteissa  muodostuvalle stressiresistenssille. 

 

•  Conclusions: In general, this study provides a basis for deepening the understanding of the physiological function of the MtFH gene and provides a reference gene for stress resistance breeding in agricultural production.