Leta i den här bloggen

onsdag 25 mars 2015

Krystalliinien perhe . CRYGA geeni Gamma-B-kristalliini

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/1418
Virallinen symboli
Virallinen nimi
crystallin, gamma A 
Synonyymit:
CRYG1; CRYG5; CRY-g-A
YHTEENVETO  Summary
 
Kristalliinit jaetaan  kahteen luokkaan, taxonispesifisiin  eli entsyymeihin ja  yleiseen luokkaan.  Jälkimmäinen ryhmä käsittää  selkärankaisten silmän linssin (mykiön)  pääasiallisia proteiineja  ja pitää yllä optista kirkkautta, läpinäkyvyyttä  ja linssin taittokykyä . Koska linssin keskiset säiesolut kadottavat tumansa kehityksen aikana, ne  muodostavat näitä kristalliineja, jotka  säilyvät koko iän ja tulevat erittäin stabiileiksi proteiineiksi.Nisäkkäiten linssikrystalliinit jaetaan alfa- beeta- ja gammaperheisiin. Beeta- ja gamma-kristalliineja pidetään superperheenä. Alfa- ja beeta-perheet jaetaan edelleen happamiin ja  emäksisiin ryhmiin.
 
Crystallins are separated into two classes: taxon-specific, or enzyme, and ubiquitous. The latter class constitutes the major proteins of vertebrate eye lens and maintains the transparency and refractive index of the lens. Since lens central fiber cells lose their nuclei during development, these crystallins are made and then retained throughout life, making them extremely stable proteins. Mammalian lens crystallins are divided into alpha, beta, and gamma families; beta and gamma crystallins are also considered as a superfamily. Alpha and beta families are further divided into acidic and basic groups.
Krystalliineissa on seitsemän proteiinialuetta: neljä homologista motiivia, yksi yhdistävä peptidi ja N- terminaali sekä C-terminaaliulokkeet. Ne säätyvät eri tavoin varhaiskehityksensä jälkeen.  Neljä gamma-kristalliinigeeniä (gamma- A- gamma -D) ja kolme pseudogeeniä (gamma-E, gamma-F, gamma-G) ovat asettuneet  peräkkäin geenisegmenttiin  geeniryppäänä. Joko ikääntymistä tai  spesifisten geenien mutaatioista johtuen gamma-kristalliinit ovat olleet vaikuttamassa kaihin muodostukseen.
 Seven protein regions exist in crystallins: four homologous motifs, a connecting peptide, and N- and C-terminal extensions. Gamma-crystallins are a homogeneous group of highly symmetrical, monomeric proteins typically lacking connecting peptides and terminal extensions. They are differentially regulated after early development. Four gamma-crystallin genes (gamma-A through gamma-D) and three pseudogenes (gamma-E, gamma-F, gamma-G) are tandemly organized in a genomic segment as a gene cluster. Whether due to aging or mutations in specific genes, gamma-crystallins have been involved in cataract formation. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Komemntti. ESIM.  Gamma krystalliini B rakenne löytyy netistä:  Lasken  aromaattiset (w ja  f) ja  merkkaan    . Löydän tästä tryptofaaneja  4 tähdettä.  Fenylalanyl-tähteitä (f)   sitä vastoin on  6 kpl.  Aromaattista  tyrosiinia (y)  näkyy olevan 15 kpl.

 w:f suhde on 4W: 6F eli 2W: 3F

ORIGIN 
  1 mgkitfyedr afqgrsyect tdcpnlqpyf srcnsirves gcwmiyerpn yqghqyflrr 
 61 geypdyqqwm glsdsirscc lipphsgayr mkiydrdelr gqmseltddc isvqdrfhlt 
121 eihslnvleg swilyempny rgrqyllrpg eyrrfldwga pnakvgslrr vmdly

Laaja artikkeli linssiproteiineista: http://www.eyecalcs.com/DWAN/pages/v1/v1c074.html

Inga kommentarer:

Skicka en kommentar